Вместе с тем город Пермь и Пермский уезд стояли накануне серьезных вспышек эпидемических заболеваний, захлестнувших город в период 1-й мировой войн, двух революций 1917 года и событий Гражданской войны 1918-1920 годов.

Вопрос о строительстве городской инфекционной больницы встал перед городской управой особенно остро в 1909-1910 годах. В начале 1909 года в Перми началась эпидемия сыпного тифа, одной из первых жертв которого стал старший врач Александровской больницы доктор Виноградов. Власти, обеспокоенные начавшейся эпидемией, предпринимали меры к локализации очагов эпидемии. Все, что имело губернское земство, согласно закону, было отдано под больных тифом арестантов и солдат Пермского гарнизона. Губернская земская управа обратилась с просьбой отдать городские заразные бараки для временного размещения тифозных больных.

С началом весны 1909 года на повестку дня вновь встал вопрос борьбы с не менее опасным инфекционным заболеванием – холерой. 18 марта 1909 года Городская дума согласилась с предложением предоставить управе на расходы по борьбе с холерой до 3 тысяч рублей из запасного городского капитала. 18 июня 1909 года городская комиссия, осмотревшая городские заразные бараки, пришла к заключению, что они «только временно, удовлетворяют своему назначению». Поэтому решено по возможности приступить к составлению проекта для устройства новых заразных бараков.

15 ноября 1909 года совместная земско-городская Комиссия по реорганизации медицинской помощи населению города Перми признала: Настоящее положение медицинской помощи населению города оставляет желать лучшего. Уплата губернскому земству 12400 рублей на содержание амбулатории Александровской больницы положение дела медицинской помощи населению не улучшит, потому что с ростом города и увеличением населения растет ежегодная потребность в медицинской помощи. Вопрос об открытии особой городской больницы – это вопрос ближайшего будущего.

Комиссия предложила проект разделения медицинской помощи населению между городом и уездным земством, с одной стороны, и губернским земством с другой стороны: «Город совместно с уездным земством в равной доле должны взять на себя лечение заразных больных, кроме больных сифилисом, для чего устраивают и содержат заразные бараки». Губернское земство, по этому проекту, должно было взять на себя лечение всех остальных больных, требующих стационарного, хирургического и прочего специального лечения, а также больных сифилисом; при этом губернское земство должно было содержать и не сокращать амбулаторию при Александровской больнице.

Однако проект земско-городской комиссии не был поддержан губернским земским собранием,  и только тогда на повестку дня встал вопрос о строительстве заразных бараков на совместные средства города и уездного земства. 17 ноября 1910 года вопрос о строительстве новых заразных бараков совместно с уездным земством принципиально был решен положительно уездным земским собранием и городской думой.

29 апреля 1911 года земско-городская комиссия по реорганизации медицинской помощи населению города Перми признала необходимым приступить к постройке постоянных заразных бараков. Для строительства заразной лечебницы были определены места: 1) На окраине города за Слободкой. Выгода этого участка была в неограниченности площади, дающей возможность в будущем свободно расширяться. 2) На участке городской земли, напротив Александровской больницы. Этот участок между  Красноуфимской улицей и Казанским трактом, имел ограниченную площадь 6600 кв. сажен, но у него было преимущество близости к Александровской больнице. Наиболее удобным для строительства заразной лечебницы, Комиссия признала место напротив Александровской больницы, так как «с постройкой здесь новых заразных корпусов образуется обособленный клинический городок, создающее большое удобство, как для больных, так и для медицинского персонала».

Система зданий для заразной лечебницы как наиболее удобная, была признана павильонная, в виде отдельно стоящих одноэтажных деревянных корпусов с центральной каменной частью. Отопление зданий – центральное водяное.

К 1 июлю 1913 года Строительный комитет по постройке зданий земско-городской заразной лечебницы предполагал окончание всех строительных работ, и оборудование их всем необходимым для правильного функционирования.

5 июля 1913 года состоялось первое заседание Распорядительного комитета по управлению Пермской Земско-Городской лечебницей для заразных больных, пригласивший на должность заведующего врача Ивана Матвеевича Напольского.

В 1913 году была построена городская (совместно с уездным земством) лечебница для заразных больных на 100 коек с пароформалиновой дезинфекционной камерой и механической прачечной. Тифозный барак на 24 кровати был торжественно освящен 13 октября 1913 года, а с 15 октября 1913 года в нем временно разместили скарлатинных больных. Тогда же были сданы в эксплуатацию холерный барак на 30 кроватей, где временно разместили тифозных больных; здание дезинфекционной камеры с прачечной; здание кухни; здание погреба и центральная часть скарлатинного барака, в котором устраивалось групповое отопление для трех бараков, здесь же временно  разместилась контора больницы. При лечебнице устроены: сортировочное отделение и временный изолятор больных с неопределенной инфекцией и больных со смешанной инфекцией.

Для постоянного исполнения христианских треб в открываемой Земско-Городской Заразной лечебнице решено было  пригласить настоятеля церкви Праведника Симеона Верхотурского при Пермской Общественной богадельне о. Дмитрия Введенского.

В связи с началом войны, из С.-Петербургского Николаевского госпиталя в Пермь прибыло 150 человек больных нижних чинов для размещения и лечения их в губернской Александровской больнице. Не имея в своем распоряжении достаточного числа мест в Александровской больнице и заразных бараках, Губернская Земская управа просила Распорядительный Комитет принять в Пермскую Земско-Городскую лечебницу больных из тифозных бараков теперь же, и сделать распоряжение администрации городских бараков на будущее принимать всех больных этой категории из Александровской больницы, с оплатой за лечение этих больных из сумм губернского земства.